Javier Fernández Ruiz ha conseguito il dottorato di ricerca in Biologia nel 1986 presso l'Università Complutense di Madrid (UCM). Attualmente è professore presso la Facoltà di Medicina dell'UCM. Da 42 anni si dedica alla ricerca ed è autore di numerosi articoli di ricerca e recensioni, capitoli di libri e brevetti, e relatore presso università, centri di ricerca e convegni. Attualmente è il Principal Investigator del gruppo di ricerca CANNABINOIDES-BBM3 dell'Istituto Universitario di Ricerca in Neurochimica di UCM, CIBERNED e IRYCIS. L'attività principale di questo gruppo è incentrata sullo studio del potenziale terapeutico dei cannabinoidi in diverse malattie neurodegenerative, attività nella quale collabora con diversi gruppi nazionali e internazionali e con diverse aziende farmaceutiche. Come ricercatore principale ha diretto diversi progetti di ricerca nazionali e internazionali. È stato presidente della Società Internazionale di Ricerca sui Cannabinoidi (ICRS) (2002-2003), nonché membro fondatore della Società Spagnola di Ricerca sui Cannabinoidi (SEIC), ricoprendo le cariche di segretario (2000-2007) e presidente (2007-2011). È attualmente membro del comitato editoriale del British Journal of Pharmacology. Negli ultimi anni ha ricevuto svariati riconoscimenti per la sua attività scientifica, tra cui lo "Special Award" dell'International Association for Cannabinoids as Medicines (IACM) nel 2019 e il "Mechoulam Award" dell'ICRS nel 2021.